Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6kb1Q8BSK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6kb1Q8BSK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms