Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp54Q8BL06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms