Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf41Q8BH75 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf41Q8BH75 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf41Q8BH75 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms