Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Best2Q8BGM5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Best2Q8BGM5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Best2Q8BGM5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Best2Q8BGM5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms