Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnpo1Q8BFY9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms