Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms