Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco5bQ80X59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco5bQ80X59 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms