Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbed4Q80WQ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbed4Q80WQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms