Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sestd1Q80UK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sestd1Q80UK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms