Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap1Q80UJ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab3gap1Q80UJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3gap1Q80UJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3gap1Q80UJ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3gap1Q80UJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab3gap1Q80UJ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms