Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms