Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mcph1Q7TT79 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mcph1Q7TT79 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcph1Q7TT79 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms