Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp3Q7TST5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp3Q7TST5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamp3Q7TST5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms