Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Igsf5Q7TSN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms