Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccp110Q7TSH4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccp110Q7TSH4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms