Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1bQ7TSF1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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