Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPV2

Dzip3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, mousemouse

Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dzip3Q7TPV2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dzip3Q7TPV2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dzip3Q7TPV2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dzip3Q7TPV2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms