Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ShprhQ7TPQ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ShprhQ7TPQ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ShprhQ7TPQ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ShprhQ7TPQ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ShprhQ7TPQ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.6 ms