Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prrc2bQ7TPM1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prrc2bQ7TPM1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms