Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mycbp2Q7TPH6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mycbp2Q7TPH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms