Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdsnQ7TPC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdsnQ7TPC1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CdsnQ7TPC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdsnQ7TPC1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdsnQ7TPC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms