Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf250Q7TNU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf250Q7TNU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf250Q7TNU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms