Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms