Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms