Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smap2Q7TN29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms