Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf139Q7TMV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf139Q7TMV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms