Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eapQ76KJ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms