Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Spcs3Q6ZWQ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spcs3Q6ZWQ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Spcs3Q6ZWQ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Spcs3Q6ZWQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Spcs3Q6ZWQ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Spcs3Q6ZWQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms