Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ncapd3Q6ZQK0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms