Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp34Q6ZQ93 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms