Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms