Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ino80Q6ZPV2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ino80Q6ZPV2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms