Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms