Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ift172Q6VH22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms