Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms