Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4aQ6Q473 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clca4aQ6Q473 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca4aQ6Q473 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms