Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nudcd1Q6PIP5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms