Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfrkbQ6PIJ4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms