Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a3Q6PIC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a3Q6PIC6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a3Q6PIC6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms