Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc57Q6PHN1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc57Q6PHN1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms