Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd13aQ6PDE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms