Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim37Q6PCX9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim37Q6PCX9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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