Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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