Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcrQ6PAJ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcrQ6PAJ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms