Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp49Q6P9L4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms