Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC061212Q6P8K3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC061212Q6P8K3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms