Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Podnl1Q6P3Y9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podnl1Q6P3Y9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms