Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrimpolQ6P1E7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrimpolQ6P1E7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms