Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga3Q6NZL0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Soga3Q6NZL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Soga3Q6NZL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms