Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ptpdc1Q6NZK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms